Un bon échantillonnage doit respecter deux règles :

• une bonne représentativité de l'échantillon par rapport à l'état nutritionnel de la plante
• une représentativité de l'échantillon pour la culture dans la zone définie.

Après la germination, la plantule accorde une priorité à la croissance racinaire car il lui faut trouver rapidement de l'eau pour assurer sa croissance pendant que la graine dispose encore de réserves. Le système racinaire continue d'avoir la priorité lorsque la plante doit trouver les éléments nutritifs peu mobiles dans le sol alors que le volume exploré par ses racines est encore limité.

La rhizosphère peut s'observer à l'œil nu. Si vous arrachez une plante, ses racines viendront avec de la terre qui reste adhérente formant des manchons autour d'elles. Attendez que la plante meure et vous n'aurez plus de terre mais seulement les racines nues en décomposition.

Les mycorhizes (du grec mykes = champignon et rhiza = racine) constituent une association entre plantes et champignons à bénéfice mutuel sur le plan nutritionnel.